通常情况下，新三板股权买卖不容易发生纠纷，由于新三板股权买卖总是都是通过全国股转系统买卖的。但并非说新三板股权买卖，就不会发生纠纷，现实日常，股权出叫人与证券公司、股权出叫人与受叫人，仍然会出现各种各样的纠纷。这个时候，想要通过法律渠道维护自己权益的，就需要选择适合的法院起诉。

现阶段，当新三板股买卖发生纠纷的时，可以到股权出售协议的约定的法院或被告所在地的法院起诉。

当事人是可以事先约定纠纷处置的法院，当出现纠纷，有没办法协商处置的，就能根据约定到指定法院提起诉讼，通过法律渠道维护自己合法权益的。假如双方没约定纠纷处置法院的，根据民事诉讼中“原告就被告”的通行原则，原告总是就需要到被告的所在地法院提起诉讼。

当然了，如果不了解该那个法院起诉的，建议向律师咨询或拿着有关资料到法院咨询员工，从而确定要到那个法院起诉。不然，一般会出现以下两种结果：被法院驳回起诉或被告提起管辖异议。

在起诉时，当法院觉得其无权管辖时，总是会驳回起诉并告知该到那个法院起诉。假如法院受理起诉，但被告觉得该法院无管辖权的，就会提起管辖异议，需要到其他有管辖权的法院进行诉讼。尽管被告提出管辖异议，不肯定成功，但一定都会拖慢诉讼进程，对原告都是不利的。

除此之外，应该注意的是，打官司就是打证据，因新三板股权出售发生纠纷了，假如没充分的有关证据资料，即使到法院起诉了，也是不可以胜诉的。如不了解该怎么样采集证据资料或采集证据资料存在困难的，可向经济纠纷律师咨询。