通常来讲，职员违纪将直接影响企业的利益，假如给公司导致直接经济损失，那样职员不免要承担损失赔偿。那样，对于给公司导致的经济损失，能否扣除职员薪资做处罚，第一得看劳动合同中的约定。

职员发生违纪状况，假如跟公司签订的劳动合同中明确有处罚约定，那样公司可以参考违纪状况扣除职员薪资。

但，公司扣除职员薪资做处罚时，不可以随便克扣职员的薪资，不然的话是损害职员利益。

具体而言，公司需要职员赔偿经济损失时，可以从职员本人的薪资中扣除，不过，每月扣除的部分不能超越职员当月薪资的20%。

假如职员被扣除后的剩余薪资部分低于当地月最低薪资标准，譬如最低某地最低薪资标准是2000，职员被扣除薪资后剩余薪资不足2000的，那样就要根据最低薪资标准2000支付。

另外，有的职员跟公司签订劳动合同时，并未明确约定有经济损失赔偿金，那样可以查找公司公示的规章规范。假如只有在规章规范中明确损失赔偿，并且规章规范是通过合法程序拟定，并且内容也符合法律法规规定的，那样同样具备法律效力。

当然，职员违纪但并未给公司导致直接经济损失，或者给导致的损失不大，但公司需要损失赔偿，或者索取的赔偿金较多，已经紧急损害到职员利益的，那样职员可以在必要的时候积极申请劳动仲裁。